Class Central is learner-supported. When you buy through links on our site, we may earn an affiliate commission.

Stepik

Молекулярная филогенетика

Bioinformatics Institute via Stepik

Overview

Курс посвящён основам филогенетики и современным методам, применяемые для построения филогении по данным последовательностей нуклеиновых кислот или белков. Кроме того, мы рассмотрим некоторые другие темы, необходимые для понимания закономерностей эволюции.

 

Syllabus

Введение. Необходимая терминология. Знакомство с деревьями


1.1 Введение


1.2 Подходит ли Вам этот курс?


1.3 Необходимая терминология


1.4 Практические аспекты обращения с деревьями

Выравнивание нуклеотидных и белковых последовательностей


2.1 Алгоритмы попарного выравнивания


2.2 Особенности выравнивания белковых последовательностей


2.3 Множественное выравнивание


2.4 Базы данных последовательностей

Методы построения и проверки деревьев


3.1 От выравнивания к дереву


3.2 Методы расстояний: UPGMA, NJ


3.3 Дискретные методы: MP, ML


3.4 Сравнение и укоренение деревьев


3.5 Тестирование топологии


3.6 Bootstrap, jackknife


3.7 Немного о байесовской статистике


3.8 Байесовские методы восстановления филогении


3.9 Байесовские методы для датировки

Эволюция гена и генома


4.1 Терминология генетики популяций и закон Харди-Вайнберга


4.2 Факторы, влияющие на популяцию


4.3 Коалесцентные методы


4.4 Гомология последовательностей и семейства генов


4.5 Маркерные гены


4.6 Заключение

Taught by

Polina Drozdova and Oleg Tarasov

Reviews

Start your review of Молекулярная филогенетика

Never Stop Learning.

Get personalized course recommendations, track subjects and courses with reminders, and more.

Someone learning on their laptop while sitting on the floor.